Στα 2 ευρώ όρισε το αντίτιμο των διοδίων σε τέσσερις σταθμούς, η Εγνατία Οδός Α.Ε. Πρόκειται για τους σταθμούς διοδίων που βρίσκονται στους νομούς Θεσσαλονίκης, Ιωαννίνων, Ροδόπης και Τρικάλων. Ο αρχικός σχεδιασμός προέβλεπε 13 σταθμούς διοδίων έως τον Απρίλιο του 2010 αλλά υπήρξαν καθυστερήσεις. Να σημειωθεί ότι η κατασκευή και η λειτουργία των σταθμών των διοδίων είναι μία από τις δύο προϋποθέσεις ώστε ο αυτοκινητόδρομος να μπορέσει να παραχωρηθεί σε ιδιώτες. Το 2013 θα τοποθετηθούν ηλεκτρονικά διόδια σε όλο το μήκος της.