Την John Cooper Works έκδοση του ηλεκτρικού Cooper SE παρουσίασε η Mini, αλλά αυτό φέρνει μόνο αισθητικές αλλαγές. Μηχανικά φορά τον ίδιο ηλεκτροκινητήρα με την απλή έκδοση, απόδοσης 218 ίππων με 330 Nm ροπής, με την μπαταρία των 54,2 kWh να χαρίζει αυτονομία έως 402 χλμ στο πρότυπο WLTP.
Τα 0-100 χλμ/ώρα τα κάνει σε 6,7 δευτερόλεπτα, με το Mini Cooper SE John Cooper Works να έχει νέες ζάντες 18″, κόκκινες δαγκάνες φρένων, διακοσμητικές ρίγες και στο εσωτερικό του τα bucket καθίσματα συνδυάζουν συνθετικό δέρμα με κόκκινες ραφές και πολύχρωμο πλεκτό ύφασμα στην περιοχή των ώμων. Η φιλοσοφία μαύρου και κόκκινου συνεχίζεται στην πλεκτή επένδυση στα πάνελ των θυρών και στο ταμπλό. Η πλευρά του συνοδηγού κοσμείται με το ειδικό μοτίβο σε στυλ καρό σημαίας.
Το μοντέλο έχει τον τρόπο λειτουργίας Go-Kart Mode που αλλάζει το χρώμα της οθόνης και τον εσωτερικό φωτισμό σε κόκκινο και εκτός από τον ειδικό ήχο Go-Kart προσφέρει και βελτιστοποιημένη απόκριση του πεντάλ του γκαζιού.
